10月3日,2026年MotoGP第16站日本大奖赛在茂木赛道完成排位赛。阿普利亚车队的豪尔赫·马丁以1分42秒371夺得杆位,杜卡迪车队的马克·马奎斯落后0.110秒排名第二,红牛KTM厂队的佩德罗·阿科斯塔位列第三。三家厂商各有一辆赛车进入头排。
马丁的杆位圈把阿莱克斯·马奎斯周五创造的1分42秒811纪录再提高0.440秒。从周五计时练习到周六排位,茂木最快单圈连续被改写;Q2前五名的成绩都快于周五的纪录,五人之间又只相差0.175秒。
Q2第一轮由马克·马奎斯领跑,他当时比阿莱克斯·马奎斯快0.065秒。第二轮马丁率先把标杆推至1分42秒371。马克·马奎斯随后两次在3号弯冲出赛道,最后一次尝试顺利完成这一弯角,却仍未超过马丁,杆位争夺以0.110秒的差距结束。
头排最后一个位置争得更紧。阿科斯塔以1分42秒493排第三,仅比马克·马奎斯慢0.012秒,并以0.037秒优势压过马可·贝泽奇。周六二练最快的贝泽奇因此位居第四,与阿莱克斯·马奎斯、法比奥·迪詹南托尼奥组成第二排。阿普利亚虽未包揽头排,但两名厂队车手均进入前四。

主场车手小椋蓝的关键一战发生在Q1。他以1分42秒883排在该阶段第一,队友劳尔·费尔南德斯仅慢0.001秒,两辆特拉克豪斯赛车一起进入Q2。弗朗切斯科·巴尼亚亚跑出1分43秒007,比第二名费尔南德斯慢0.123秒,无缘晋级,最终排位名次为第十三。
两位从Q1晋级的车手在Q2走出了不同结果:费尔南德斯把成绩提高到1分42秒741,获得第八名;小椋蓝则以1分42秒933排第十一。小椋蓝在Q1跑得更快,但前十二名必须按Q2成绩排序,Q1圈速不会带入Q2,因此不能把两个阶段的最快圈混在一起重排。
埃内亚·巴斯蒂亚尼尼获得第七名,排在费尔南德斯之前。本田LCR的迪奥戈·莫雷拉与嘉实多本田LCR的约翰·扎尔科分列第九、第十,两人只差0.002秒。扎尔科在Q2摔车,MotoGP官方确认他无大碍。法比奥·夸塔拉罗排第十二,是本场唯一进入Q2的雅马哈车手。
Q1未晋级的十名车手接在Q2十二人之后:巴尼亚亚第十三,弗兰科·莫比德利第十四,本田车队的颂基亚特·占叻和卢卡·马里尼分列第十五、第十六。下表同时列出22位车手的Q1、Q2成绩,未参加对应阶段的位置以横线表示;名次为本次排位结果。
| 名次 | 车号 | 车手 | 车队 | Q1成绩 | Q2成绩 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 89 | 豪尔赫·马丁 | 阿普利亚车队 | – | 1:42.371 |
| 2 | 93 | 马克·马奎斯 | 杜卡迪车队 | – | 1:42.481 |
| 3 | 37 | 佩德罗·阿科斯塔 | 红牛KTM厂队 | – | 1:42.493 |
| 4 | 72 | 马可·贝泽奇 | 阿普利亚车队 | – | 1:42.530 |
| 5 | 73 | 阿莱克斯·马奎斯 | 格雷西尼车队 | – | 1:42.546 |
| 6 | 49 | 法比奥·迪詹南托尼奥 | VR46车队 | – | 1:42.628 |
| 7 | 23 | 埃内亚·巴斯蒂亚尼尼 | 红牛KTM Tech3 | – | 1:42.669 |
| 8 | 25 | 劳尔·费尔南德斯 | 特拉克豪斯车队 | 1:42.884 | 1:42.741 |
| 9 | 11 | 迪奥戈·莫雷拉 | 本田LCR | – | 1:42.916 |
| 10 | 5 | 约翰·扎尔科 | 嘉实多本田LCR | – | 1:42.918 |
| 11 | 79 | 小椋蓝 | 特拉克豪斯车队 | 1:42.883 | 1:42.933 |
| 12 | 20 | 法比奥·夸塔拉罗 | 雅马哈车队 | – | 1:43.059 |
| 13 | 63 | 弗朗切斯科·巴尼亚亚 | 杜卡迪车队 | 1:43.007 | – |
| 14 | 21 | 弗兰科·莫比德利 | VR46车队 | 1:43.136 | – |
| 15 | 15 | 颂基亚特·占叻 | 本田车队 | 1:43.196 | – |
| 16 | 10 | 卢卡·马里尼 | 本田车队 | 1:43.278 | – |
| 17 | 33 | 布拉德·宾德 | 红牛KTM厂队 | 1:43.399 | – |
| 18 | 54 | 费尔明·阿尔德格尔 | 格雷西尼车队 | 1:43.419 | – |
| 19 | 12 | 马弗里克·维纳莱斯 | 红牛KTM Tech3 | 1:43.605 | – |
| 20 | 43 | 杰克·米勒 | 普拉马克车队 | 1:43.811 | – |
| 21 | 42 | 阿莱克斯·林斯 | 雅马哈车队 | 1:43.896 | – |
| 22 | 7 | 托普拉克·拉兹加特利奥卢 | 普拉马克车队 | 1:44.031 | – |